Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SelenofQ9ERR7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenofQ9ERR7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms