Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tfip11Q9ERA6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tfip11Q9ERA6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms