Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Capn12Q9ER56 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn12Q9ER56 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms