Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rapgef4Q9EQZ6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rapgef4Q9EQZ6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rapgef4Q9EQZ6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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