Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chst1Q9EQC0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chst1Q9EQC0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chst1Q9EQC0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chst1Q9EQC0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chst1Q9EQC0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chst1Q9EQC0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chst1Q9EQC0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chst1Q9EQC0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms