Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pold3Q9EQ28 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pold3Q9EQ28 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pold3Q9EQ28 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pold3Q9EQ28 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pold3Q9EQ28 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pold3Q9EQ28 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pold3Q9EQ28 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pold3Q9EQ28 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pold3Q9EQ28 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pold3Q9EQ28 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pold3Q9EQ28 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pold3Q9EQ28 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Pold3Q9EQ28 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pold3Q9EQ28 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pold3Q9EQ28 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pold3Q9EQ28 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms