Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP82

Wdr4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr4Q9EP82 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Wdr4Q9EP82 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Wdr4Q9EP82 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms