Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan4Q9DCK3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan4Q9DCK3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan4Q9DCK3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan4Q9DCK3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan4Q9DCK3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan4Q9DCK3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan4Q9DCK3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan4Q9DCK3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan4Q9DCK3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan4Q9DCK3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan4Q9DCK3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan4Q9DCK3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan4Q9DCK3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms