Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GabarapQ9DCD6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms