Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Foxp4Q9DBY0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxp4Q9DBY0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms