Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnpy3Q9DAU1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnpy3Q9DAU1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnpy3Q9DAU1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnpy3Q9DAU1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnpy3Q9DAU1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnpy3Q9DAU1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnpy3Q9DAU1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnpy3Q9DAU1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms