Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc89Q9DA73 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc89Q9DA73 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms