Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Erp27Q9D8U3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erp27Q9D8U3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms