Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms