Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs6Q9D6W8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms