Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11fip1Q9D620 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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Rab11fip1Q9D620 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Rab11fip1Q9D620 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab11fip1Q9D620 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Rab11fip1Q9D620 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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