Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ubxn11Q9D572 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn11Q9D572 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms