Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clvs1Q9D4C9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms