Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4933425L06RikQ9D3Z8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4933425L06RikQ9D3Z8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms