Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1cQ9D300 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1cQ9D300 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms