Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vsig1Q9D2J4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vsig1Q9D2J4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vsig1Q9D2J4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms