Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Batf3Q9D275 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Batf3Q9D275 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms