Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl8bQ9D1F0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl8bQ9D1F0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rtl8bQ9D1F0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rtl8bQ9D1F0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rtl8bQ9D1F0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rtl8bQ9D1F0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rtl8bQ9D1F0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rtl8bQ9D1F0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms