Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C9

Rrp7a, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp7aQ9D1C9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rrp7aQ9D1C9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rrp7aQ9D1C9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Rrp7aQ9D1C9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rrp7aQ9D1C9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms