Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem88Q9D0N8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem88Q9D0N8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem88Q9D0N8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem88Q9D0N8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem88Q9D0N8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem88Q9D0N8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem88Q9D0N8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem88Q9D0N8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem88Q9D0N8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem88Q9D0N8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem88Q9D0N8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem88Q9D0N8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem88Q9D0N8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem88Q9D0N8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem88Q9D0N8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms