Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms