Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp11Q9CZJ1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms