Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Yif1bQ9CX30 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Yif1bQ9CX30 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms