Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpusd4Q9CWX4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms