Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxxc1Q9CWW7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxxc1Q9CWW7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cxxc1Q9CWW7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms