Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms