Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms