Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NmbQ9CR53 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NmbQ9CR53 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms