Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifitm3Q9CQW9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifitm3Q9CQW9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifitm3Q9CQW9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifitm3Q9CQW9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ifitm3Q9CQW9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifitm3Q9CQW9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms