Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PsenenQ9CQR7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PsenenQ9CQR7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms