Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rdm1Q9CQK3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rdm1Q9CQK3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms