Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap3bQ9CQE1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms