Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl39lQ9CQD0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl39lQ9CQD0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl39lQ9CQD0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl39lQ9CQD0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl39lQ9CQD0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rpl39lQ9CQD0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl39lQ9CQD0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl39lQ9CQD0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl39lQ9CQD0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rpl39lQ9CQD0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rpl39lQ9CQD0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Rpl39lQ9CQD0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
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