Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nudcd2Q9CQ48 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudcd2Q9CQ48 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms