Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bhlhe41Q99PV5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms