Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcgf6Q99NA9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pcgf6Q99NA9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pcgf6Q99NA9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms