Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH5

Nme5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme5Q99MH5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nme5Q99MH5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nme5Q99MH5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms