Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp1b4Q99ME6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp1b4Q99ME6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1b4Q99ME6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms