Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp1b1Q99LU0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp1b1Q99LU0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms