Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arrdc1Q99KN1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arrdc1Q99KN1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms