Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smim11aQ99J19 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Smim11aQ99J19 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smim11aQ99J19 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smim11aQ99J19 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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