Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu1Q99J10 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu1Q99J10 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
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