Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn16Q925N4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cldn16Q925N4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cldn16Q925N4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cldn16Q925N4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cldn16Q925N4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cldn16Q925N4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cldn16Q925N4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cldn16Q925N4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Cldn16Q925N4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn16Q925N4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn16Q925N4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms