Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps3Q91VB4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 263 ms