Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacng5Q8VHW4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms